La Facultad está organizada académicamente en departamentos, que son grupos unidos por una afinidad disciplinaria y equilibrados en cuanto a la atención de tareas de enseñanza de grado y posgrado, de investigación y transferencia de tecnología. Son dirigidos por un director, quien debe ser profesor ordinario de una asignatura o proyecto de investigación del departamento.
Por su parte, los directores de carreras son designados para perfeccionar y actualizar la propuesta académica de las mismas, a través de una conducción experta en las especificidades disciplinares y comprometida con las misiones institucionales de la Facultad.

Directores de Departamento

  Departamento   Director   Correo
  Cartografía y Agrimensura   Horacio De Nardo   hdenardo@hotmail.com
  Estructuras   Vanina Cicchellero   vanina.cicchellero@gmail.com
  Formación Básica   Elisabet Haye   elihaye@gmail.com
  Formación Complementaria   Lucila Grand   lucila.grand@gmail.com
  Hidráulica   Carlos Ramonell   cgramonell@yahoo.com.ar
  Hidrología   Alejandra Arbuet Moraes   alearbuet@fich.unl.edu.ar
  Informática   Lucila Romero   lucila.rb@gmail.com
  Medio Ambiente   Esteban Fornero   elfornero@santafe-conicet.gov.ar